Готовый перевод THE HUMAN PROTEIN ATLAS: ASSAYS AND ANNOTATION / The Human Protein Atlas: Исследования и аннотация [!!!ТРЕБУЮТСЯ ПЕРЕВОДЧИКИ (СМ. ОПИСАНИЕ)!!!]: Immunohistochemistry - cells

Описание

Как дополнение к представлению нормальной и опухолевой ткани, The Protein Atlas отображает образы селекции широко используемых и хорошо изученных клеточных линий человека, а также образцов клеток от здоровых индивидуумов и от пациентов с лейкемией/лимфомой.

Чтобы обеспечить иммуногистохимическое окрашивание набора клеточных линий и клеточных образцов, был использован клеточный микрочип.

Включенные клеточные линии получены от DSMZ, ATCC или академических исследовательских групп (любезно предоставленные основателями клеточных линий).

Информация относительно пола и возраста донора, происхождения ткани и источника представлена здесь.

Все клетки зафиксированы в 4% параформальдегиде и помещены в агарозу до заливки парафина и иммуногистохимического окрашивания.

В то время как TMAs [(тканевые микрочипы)] включают образцы из твёрдых опухолей, CMA [(клеточные микрочипы)] дают возможность представить клеточные линии лейкемии и лимфомы, охватывая главные гемопоэтические опухоли и даже различные стадии дифференцировки.

В добавок, некоторые твёрдые опухоли, не представленные в TMA, представлены как клеточные линии в CMA, например, саркома, холангиокарцинома и мелкоклеточная легочная карцинома.

Одновременное окрашивание с использованием одинакового протокола для тканевых и клеточных чипов позволяет сравнить IHC окрашивание между клеточными линиями и тканями.

Некоторые опухоли, включенные в TMA, также представлены клеточными линиями, полученными из соответствующих типов опухоли.

Используемые иммуногистохимические протоколы привели к коричнево-чёрному окрашиванию, локализованному там, где антитело связалось с соответствующим антигеном.

Кроме того, участок [ткани] гистохимически окрашен гематоксилином для того, чтобы дать возможность визуализировать микроскопические особенности.

Гематоксилиновая окрска является неспецифической, и приводит к синему окрашиванию и клеток, и внеклеточного материала.

Аннотация.

Для того, чтобы обеспечить обзор образцов белковой экспрессии, все образы иммуногистохимически окрашенных клеточных линий были аннотированны с помощью программы автоматического распознавания для анализа образов.

Программа анализа образов - TMAx (Beecher Instruments, Sun Prairie, WI, USA) - построена на объектно-ориентированном движке анализа образов от Definiens,

Выходные параметры программы всегда показывались вместе с аннотированными образами:

- количество объектов, определяемое [количеством] клеток в образе.

- интенсивность окрашивания (негативное, слабое, среднее и сильное).

- доля (%) позитивных клеток.

Отображаемая информация включает:

- объектно-основанный вид отображаемой доли (%) иммуногистохимически окрашенных клеток.

Цветовой код для каждой клетки отображает диапазон иммунореактивности: синий (негативный/очень слабый), жёлтый (слабый/средний), оранжевый (средний/сильный) и красный (сильный) [цвет] клетки.

Эта классификация основана на областях различной интенсивности внутри каждого объекта (клетки).

Она немного отличается от субъективной классификации, предоставленной ручной аннотацией клеток в нормальной и опухолевой ткани.

основанный на областях вид отображаемых иммуноокрашенных областей (%) внутри клеток.

Цветной код отображает спектр иммунореактивности: жёлтый (слабый/средний), зелёный (средний/сильный) и красный (сильный).

Негативная/очень слабая области прозрачны.

Скор интенсивностей генерируется с помощью областно-ориентированного анализа.

Внимание! Этот перевод, возможно, ещё не готов.
Его статус: идёт перевод

Переведено на Нотабеноиде
http://notabenoid.org/book/36478/130911

Переводчики: platon_work