THE HUMAN PROTEIN ATLAS: ASSAYS AND ANNOTATION / The Human Protein Atlas: Исследования и аннотация [!!!ТРЕБУЮТСЯ ПЕРЕВОДЧИКИ (СМ. ОПИСАНИЕ)!!!]: Immunohistochemistry - cells

Оглавление

Сбросить всё

Английский оригинал	Перевод на русский
Сожалеем, но текст оригинала доступен только зарегистрированным пользователям.	Описание platon_work 14.01.13 в 15:55 0
	Как дополнение к представлению нормальной и опухолевой ткани, The Protein Atlas отображает образы селекции широко используемых и хорошо изученных клеточных линий человека, а также образцов клеток от здоровых индивидуумов и от пациентов с лейкемией/лимфомой. platon_work 14.01.13 в 16:46 0
	Чтобы обеспечить иммуногистохимическое окрашивание набора клеточных линий и клеточных образцов, был использован клеточный микрочип. platon_work 14.01.13 в 16:50 0

	Включенные клеточные линии получены от DSMZ, ATCC или академических исследовательских групп (любезно предоставленные основателями клеточных линий). platon_work 14.01.13 в 18:01 0
	Информация относительно пола и возраста донора, происхождения ткани и источника представлена здесь. platon_work 14.01.13 в 18:12 0
	Все клетки зафиксированы в 4% параформальдегиде и помещены в агарозу до заливки парафина и иммуногистохимического окрашивания. platon_work 14.01.13 в 18:35 0
	В то время как TMAs [(тканевые микрочипы)] включают образцы из твёрдых опухолей, CMA [(клеточные микрочипы)] дают возможность представить клеточные линии лейкемии и лимфомы, охватывая главные гемопоэтические опухоли и даже различные стадии дифференцировки. platon_work 14.01.13 в 18:49 0
	В добавок, некоторые твёрдые опухоли, не представленные в TMA, представлены как клеточные линии в CMA, например, саркома, холангиокарцинома и мелкоклеточная легочная карцинома. platon_work 14.01.13 в 21:10 0
	Одновременное окрашивание с использованием одинакового протокола для тканевых и клеточных чипов позволяет сравнить IHC окрашивание между клеточными линиями и тканями. platon_work 14.01.13 в 21:27 0
	Некоторые опухоли, включенные в TMA, также представлены клеточными линиями, полученными из соответствующих типов опухоли. platon_work 14.01.13 в 21:29 0
	Используемые иммуногистохимические протоколы привели к коричнево-чёрному окрашиванию, локализованному там, где антитело связалось с соответствующим антигеном. platon_work 14.01.13 в 21:39 0
	Кроме того, участок [ткани] гистохимически окрашен гематоксилином для того, чтобы дать возможность визуализировать микроскопические особенности. platon_work 14.01.13 в 21:45 0
	Гематоксилиновая окрска является неспецифической, и приводит к синему окрашиванию и клеток, и внеклеточного материала. platon_work 14.01.13 в 21:53 0
	Аннотация. platon_work 14.01.13 в 21:54 0
	Для того, чтобы обеспечить обзор образцов белковой экспрессии, все образы иммуногистохимически окрашенных клеточных линий были аннотированны с помощью программы автоматического распознавания для анализа образов. platon_work 14.01.13 в 22:24 0
	Программа анализа образов - TMAx (Beecher Instruments, Sun Prairie, WI, USA) - построена на объектно-ориентированном движке анализа образов от Definiens, platon_work 14.01.13 в 22:34 0	+1
	Выходные параметры программы всегда показывались вместе с аннотированными образами: platon_work 14.01.13 в 22:43 0
	- количество объектов, определяемое [количеством] клеток в образе. platon_work 14.01.13 в 22:44 0
	- интенсивность окрашивания (негативное, слабое, среднее и сильное). platon_work 14.01.13 в 22:46 0
	- доля (%) позитивных клеток. platon_work 14.01.13 в 22:47 0
		+1
	Отображаемая информация включает: platon_work 14.01.13 в 22:52 0
	- объектно-основанный вид отображаемой доли (%) иммуногистохимически окрашенных клеток. platon_work 14.01.13 в 22:54 0	+1
	Цветовой код для каждой клетки отображает диапазон иммунореактивности: синий (негативный/очень слабый), жёлтый (слабый/средний), оранжевый (средний/сильный) и красный (сильный) [цвет] клетки. platon_work 14.01.13 в 23:06 0
	Эта классификация основана на областях различной интенсивности внутри каждого объекта (клетки). platon_work 14.01.13 в 23:11 0
	Она немного отличается от субъективной классификации, предоставленной ручной аннотацией клеток в нормальной и опухолевой ткани. platon_work 14.01.13 в 23:22 0
	основанный на областях вид отображаемых иммуноокрашенных областей (%) внутри клеток. platon_work 14.01.13 в 23:27 0
	Цветной код отображает спектр иммунореактивности: жёлтый (слабый/средний), зелёный (средний/сильный) и красный (сильный). platon_work 14.01.13 в 23:43 0
	Негативная/очень слабая области прозрачны. platon_work 14.01.13 в 23:48 0
	Скор интенсивностей генерируется с помощью областно-ориентированного анализа. platon_work 14.01.13 в 23:50 0	+1