ProtRepeatsDB: a database of amino acid repeats in genomes (Abstract+Background) / ProtRepeatsDB: база данных аминокислотных повторов в геномах (только общие сведения): Abstract

Оглавление

Сбросить всё

Английский оригинал	Перевод на русский
Сожалеем, но текст оригинала доступен только зарегистрированным пользователям.	История вопроса: Полногеномные и межвидовые сравнения аминокислотных повторов - интригующая проблема в биологии главным образом из-за высокополиморфной природы и разнообразных функций этих повторов. platon_work 03.04.13 в 12:59 0
	Повторы в характерной для вида структуре белка составляют жизненно важные функциональные и структурные регионы. platon_work 03.04.13 в 13:19 0
	Повторы являются существенным следствием эволюции белков, что видно из анализов повторов в различных организмах. platon_work 03.04.13 в 13:33 0
	В постгеномную эру доступность сиквенсов белков, закодированных в различных геномах, предоставляет уникальную возможность произвести крупномасштабные сравнительные исследования аминокислотных повторов. platon_work 03.04.13 в 14:14 0
	ProtRepeatsDB (http://bioinfo.icgeb.res.in/repeats/) - это реляционная база данных точных и неточных повторов, доступ к которой выполнен как средство и набор инструментов для выявления и межвидового сравнения различных типов аминокислотных повторов. platon_work 03.04.13 в 14:37 0	+2
	~ platon_work 03.04.13 в 14:39 0
	Описание: ProtRepeatsDB (v1.2) включает точные и неточные аминокислотные повторы в белковых сиквенсах 141 организма, геномы которых доступны на данный момент. platon_work 03.04.13 в 20:11 0
	Веб-интерфейс ProtRepeatsDB состоит из различных инструментов, позволяющих представить повторы, основываясь на ID белка, имени организма, повторяющейся последовательности и ключевых словах в заголовках FASTA-файлов, размере, частоте, ID аннотаций gene ontology (GO) и регулярных выражениях (REGEXP) описания повторов. platon_work 03.04.13 в 20:34 0
	Эти инструменты также позволяют формулировать множество простых, сложных и логических запросов, чтобы упростить mining и крупномасштабные межвидовые сравнения аминокислотных повторов. platon_work 03.04.13 в 20:56 0
	Кроме того, база данных также содержит инструменты анализа сиквенсов, чтобы выявлять повторы во введённых пользователем сиквенсах. platon_work 03.04.13 в 21:15 0
	~ platon_work 03.04.13 в 21:15 0
	Заключение: ProtRepeatsDB - база данных различных типов представленных в белках аминокислотных повторов, где собраны данные для многих организмов. platon_work 03.04.13 в 21:35 0
	Она интегрирует полезные инструменты для выполнения запросов по всему геному для быстрого скрининга и идентификации аминокислотных повторов и облегчает сравнительные и эволюционные исследования повторов. platon_work 03.04.13 в 21:46 0
	База данных полезна для идентификации видо- или организмо-специфичных повторных маркеров, межвидовых вариаций и полиморфизммов. platon_work 03.04.13 в 21:53 0