SNAP (SNP Annotation and Proxy Search): Documentation / Документация к SNAP (Аннотация SNP и "Ближний Поиск"): SNAP documentation

Оглавление

Сбросить всё

←

→

Английский оригинал	Перевод на русский
Сожалеем, но текст оригинала доступен только зарегистрированным пользователям.	SNAP platon_work 21.10.14 в 21:54 0
	Аннотация SNP и "Ближний Поиск" (SNP Annotation and Proxy Search) platon_work 21.10.14 в 21:55 0
	Версия 2.2 Примечания переводчика: 1. В квадратных скобках -- содержимое ячеек таблиц из исходного текста. 2. Названия элементов интерфейса SNAP я дублирую в перевод. Не всегда их можно и нужно переводить. platon_work 21.10.14 в 21:54 0
	~~ platon_work 21.10.14 в 21:55 0
	Поисковый сервис SNAP позволяет найти близлежащие SNPs, основываясь на неравновесном сцеплении генов, физической дистанции и принадлежности выбранным коммерческим чипам для генотипирования. platon_work 21.10.14 в 22:40 0
	SNAP также может создавать графики, показывающие региональное неравновесное сцепление генов или региональную ассоциацию. platon_work 21.10.14 в 22:47 0
	~~ platon_work 21.10.14 в 22:49 0
	SNAP: Источники Данных platon_work 21.10.14 в 22:50 0
	~~ platon_work 21.10.14 в 22:50 0
	Данные по неравновесному сцеплению генов вычислены с помощью Haploview 4.0, основываясь на разделённых на фазы генотипических данных из международного проекта HapMap и проекта 1000 Genomes. platon_work 21.10.14 в 23:05 0
	См. SNP Data Set (Набор SNP) для получения большей информации. platon_work 21.10.14 в 23:10 0
	~ platon_work 21.10.14 в 23:10 0
	Координаты в геноме, данные по генетическому картированию и скоростям рекомбинации взяты из международного проекта HapMap или из проекта 1000 Genomes. platon_work 21.10.14 в 23:53 0
	~ platon_work 21.10.14 в 23:54 0
	Информация о составе перечисленных коммерческих чипов получена из данных, опубликованных производителями чипов. platon_work 22.10.14 в 00:12 0
	~ platon_work 22.10.14 в 00:13 0
	Аннотации SNPs и генов взяты из GeneCruiser. platon_work 22.10.14 в 00:18 0
	Аннотации из GeneCruiser основаны на базе данных Ensembl. platon_work 22.10.14 в 00:26 0
	Ensembl автоматически аннотирует и индексирует данные из нескольких источников, таких как Entrez, RefSeq, EMBL, Uniprot/SWISS-PROT, Affymetrix и Gene Ontology (GO). platon_work 22.10.14 в 00:44 0
	~ platon_work 22.10.14 в 00:44 0
	Данные для генных треков на графиках SNAP'а взяты из RefSeq-трека UCSC Genome Browser'а. platon_work 22.10.14 в 01:20 0
	~~ platon_work 22.10.14 в 01:26 0
	Proxy Search (Ближний Поиск) platon_work 22.10.14 в 16:59 0
	~~ platon_work 22.10.14 в 16:59 0
	Функция ближнего поиска позволяет находить близлежащие SNPs, основываясь на различных критериях, включая неравновесное сцепление генов, физическую дистанцию и информацию, присутствует ли запрашиваемый и/или близлежащий SNP в выбранных коммерческих чипах для генотипирования. platon_work 22.10.14 в 17:54 0
	~~ platon_work 22.10.14 в 22:54 0
	Proxy Search (Ближний Поиск): входные данные platon_work 22.10.14 в 22:58 0
	~~ platon_work 22.10.14 в 23:02 0
	Функция ближнего поиска поддерживает следующие входные данные. platon_work 23.10.14 в 15:10 0
	~ platon_work 23.10.14 в 17:53 0
	Input SNPs (Входные SNPs) platon_work 23.10.14 в 17:53 0
	~ platon_work 23.10.14 в 17:54 0
	Выберите метод, который бы вы предпочли, чтобы выбрать запрашиваемые SNPs. platon_work 23.10.14 в 18:10 0
	~ platon_work 23.10.14 в 18:10 0
	[ File (Файл) ] [ Позволяет залить файл, содержащий список названий SNP (rs-номера). platon_work 23.10.14 в 19:33 0
	~ platon_work 23.10.14 в 23:32 0
	По умолчанию предполагается, что файл содержит список названий SNP, одно на строку. platon_work 23.10.14 в 23:50 0
	Если файл форматирован в столбцах (разделённых пробелами), можете указать тот столбец, который содержит названия SNP, а также есть ли в файле строка-заголовок, которую можно игнорировать. ] platon_work 24.10.14 в 00:09 0
	~ platon_work 24.10.14 в 00:10 0
	[ Text Input (Входной текст) ] [ Позволяет вам ввести названия SNPs или вставить их в текстбокс, одно название SNP на строку. ] platon_work 24.10.14 в 00:15 0
	~ platon_work 24.10.14 в 00:23 0
	[ Genomic Locus (позиция в геноме) ] [ Позволяет вам выбрать запрашиваемые SNPs с помощью указания хромосомы и стартовых/конечных координат. platon_work 24.10.14 в 00:23 0
	~ platon_work 24.10.14 в 01:06 0
	Если вы опустите стартовую и конечную координаты, то значением по умолчанию станет конец хромосомы. platon_work 24.10.14 в 01:12 0
	Существует лимит в 1 Мпн на запросы по геномному локусу. ] platon_work 24.10.14 в 01:41 0
	~ platon_work 24.10.14 в 01:47 0
	SNP Data Set (Набор SNP) platon_work 24.10.14 в 01:51 0
	~ platon_work 24.10.14 в 23:00 0
	Данные по неравновесному сцеплению генов основаны на наборе SNP и выбранной панели. platon_work 25.10.14 в 00:59 0
	~ platon_work 25.10.14 в 01:00 0

Следующая страница →