Arc: комментарии

Для англоязычных 1 это тоже i или l, 0 это О но пишут же, т.к. это подчеркивает comp style, сленг.
Ну а если уже надо по звучанию, то тогда «Мафриа», но никак не Ма-три-а вот ролик с анг. звучанием: http://www.youtube.com/watch?v=5Ca44YewmoQ
Аналогично для
I-No – Ай-Ноу, а не Ай-Но

Добавлю в названия для обсуждения
fCon – так и оставить.
CMD – так оставить CMD. В переводе это значит «командная строчка» или «консоль» в текстах из «TRON 2.0, Сообщения\задания: Часть 2» в конце. Иногда это сокращение от «command», но в указанных текстах это консоль.
ID – ИД или так оставить, но ИД редко встречаю, скорее используют «ID» или «идентификатор». Но есть иногда другой перевод вроде «message ID – код сообщения»

Согласен в зависимости от контекста это слово может переводится как «поврежден» или «испорчен», но и «искажение» тоже иногда можно встретить. К примеру 1 предложение в роли глагола можно по разном перевести:
data corrupt – искажение данных, порча данных.

Help, Help file(s) – Справка, Файл(ы) Справки.
Обратите внимание на сохранение регистра с оригиналом, т.к. это сделано чтобы выделить слова.
А по поводу перевода «Справка» это уже устоявшийся перевод Хэлпа, откройте большинство программ. Хотя иногда можно встретить слова «Помощь»

Mercury. Поддержу Resident10 в варианте Меркури.
Kernel. Считаю это не имя , а просто его название программы, которое является проекций реального Ядра системы. Не забываем что игра подразумевает, что весь мир игры это компьютерные системы, периферия, соединения между ЭВМ так сказать глазами программ. Я хочу сказать, что программы, которые общаются с Ядром к нему так и обращаются. А вот полиморфные программы с минимальным ИИ и программы-пользователи это уже другое.

Начнем с того зачем вообще переводить это имя?
Давно проходил игру, но помню что это вроде сокращение для программы. Еще в имени специально стоит цифра поддерживая атмосферу игры, там же не написано Ma-three-a, Ma-two-a.
Предлагаю вам оставить как есть Ma3a, Ма2а, Ма1а, к тому же пока играл привык эту программу Мазой обзывать ;).