Рассказ Taq

Оглавление

Сбросить всё

←

→

Английский оригинал	Перевод на русский
Сожалеем, но текст оригинала доступен только зарегистрированным пользователям.	Рассказ Taq (написанный с Йеном Вонгом). Dawkinsian 09.05.11 в 18:34 0	+3
	Достигнув нашего самого древнего рандеву и собрав в нашем путешествии всю жизнь как мы ее знаем, мы теперь можем осмотреть ее разнообразие. Dawkinsian 09.05.11 в 18:40 0
	На самом глубинном уровне разнообразие жизни является химическим. cosinus 10.05.11 в 08:01 0
	Профессии, к которым способны наши коллеги-пилигримы, охватывают множество химических искусств. Dawkinsian 09.05.11 в 18:42 0
	Как мы видели, бактерии, включая архей, демонстрируют самый широкий набор химических способностей. Dawkinsian 09.05.11 в 18:43 0
	Бактерии, взятые как группа, являются властителями химии на этой планете. Dawkinsian 09.05.11 в 18:44 0	+1
	Даже химия наших собственных клеток во многом заимствована у бактериальных гастарбайтеров, и это составляет лишь долю того, на что способны бактерии. Dawkinsian 09.05.11 в 18:45 0	+2
	Химически мы более схожи с некоторыми бактериями, чем некоторые бактерии с другими бактериями. Dawkinsian 09.05.11 в 18:46 0
	По крайней мере, с точки зрения химика, если вы уничтожите все живое, кроме бактерий, у вас по-прежнему останется большая часть разнородности жизни. Dawkinsian 09.05.11 в 18:47 0
	Конкретной бактерией, выбранной мною, чтобы рассказать эту историю, является Thermus aquaticus, известная молекулярным биологам как Taq. Dawkinsian 09.05.11 в 18:48 0
	Разные бактерии кажутся нам чуждыми по различным отдельным причинам. Dawkinsian 09.05.11 в 18:49 0
	Thermus aquaticus, как предполагает ее название, предпочитает жить в горячей воде. Dawkinsian 09.05.11 в 18:49 0
	В очень горячей воде. Dawkinsian 09.05.11 в 18:49 0
	Как мы видели на Рандеву 38, многие из архей - термофилы и гипертермофилы, но археи не имеют монополии на эту сферу жизни. Dawkinsian 09.05.11 в 18:50 0
	Термофилы и гипертермофилы - не таксономические категории, а нечто более похожее на профессии или гильдии, как чосеровские Студент, Мельник и Врач. Dawkinsian 09.05.11 в 18:51 0
	Они живут в местах, где ничто другое жить не может: в обжигающе горячих источниках Роторуа и Йеллоустонского парка или в жерлах вулканов срединно-океанических хребтов. Dawkinsian 09.05.11 в 18:53 0
	Thermus -- эубактерия-гипертермофил. Dawkinsian 09.05.11 в 18:53 0
	Она может выжить без особых проблем в почти кипящей воде, хотя предпочитает более приятные 70°C или около того. Dawkinsian 09.05.11 в 18:54 0
	Она не держит мировой рекорд по температуре: существуют глубоководные океанские археи, которые процветают до 115 C, гораздо выше нормальной точки кипения воды. Dawkinsian 09.05.11 в 18:56 0
	Thermus знаменита в кругах молекулярных биологов тем, что является источником фермента дупликации ДНК, известного как Taq полимераза. Dawkinsian 09.05.11 в 18:58 0
	Конечно, все организмы имеют ферменты для дупликации ДНК, но Thermus была вынуждена развить тот, что может выдерживать температуры, близкие к точке кипения. Dawkinsian 09.05.11 в 18:59 0
	Это пригодилось молекулярным биологам, поскольку самый простой способ подготовить ДНК к дупликации - это нагреть ее, разделяя на две составляющие нити. Dawkinsian 09.05.11 в 19:00 0
	Повторное нагревание и охлаждение раствора, содержащего и ДНК и Taq полимеразу, дуплицирует (или "амплифицирует") даже самые крошечные количества исходной ДНК. Dawkinsian 09.05.11 в 19:02 0
	Этот метод называется "полимеразной цепной реакцией" или PCR, и он блестяще продуман. Dawkinsian 09.05.11 в 19:03 0
	Слава Thermus как волшебницы биохимической лаборатории - достаточное основание для того, чтобы позволить ей рассказать эту историю. Dawkinsian 09.05.11 в 19:04 0
	Но, между прочим, может быть другая причина, почему Thermus особенно хорошо подходит, чтобы представить поучительно чуждую точку зрения бактерий. cosinus 10.05.11 в 08:12 0	+1
	Thermus принадлежит к маленькой группе бактерий, известных как галобактерии (Hadobacteria). Dawkinsian 09.05.11 в 19:06 0	+2
	В своей таксономической схеме, упомянутой на Рандеву 39, Том Кавалир-Смит предположил, что галобактерии вместе со своими кузенами, зелеными несернистыми бактериями, могут быть самой ранней отделившейся бактериальной группой. Dawkinsian 09.05.11 в 19:08 0	+2
	Если так, их группа - настолько дальняя родственница всей остальной жизни, насколько вообще возможно. Dawkinsian 09.05.11 в 19:09 0
	Согласно этому взгляду, Thermus и ее родственники находятся на отшибе. Dawkinsian 09.05.11 в 19:10 0	+2
	Все остальные бактерии разделяют друг с другом и с остальной жизнью общего предка, которого не разделяет Thermus. Dawkinsian 09.05.11 в 19:11 0
	Если это подтвердится, это будет означать следующее. Dawkinsian 09.05.11 в 19:11 0
	Точно так же как любая бактерия может группировать "остальное живое" в одну "младшую ветвь" семейного дерева живого, так же среди самих бактерий Thermus может группировать "остальных бактерий" в одну ветвь группы бактерии. Dawkinsian 09.05.11 в 19:13 0	+2
	Вместе с ее пристрастием находиться в кипятке, это может быть той причиной, по которой я выбрал Thermus на роль рассказчика истории о разнообразии жизни. Dawkinsian 09.05.11 в 19:15 0	+2
	Но поскольку свидетельства в пользу особого статуса Thermus не очень надежны, нет никаких сомнений, что большая часть разнообразия жизни на фундаментальном уровне химии - микробное, и подавляющее его большинство - бактерии. Dawkinsian 10.05.11 в 05:56 0
	История о разнообразии жизни, поскольку это в основном химическое разнообразие, по праву рассказывается бактерией, и это вполне может быть Taq. Dawkinsian 10.05.11 в 05:57 0
	Традиционно и по понятным причинам эта история была рассказана с точки зрения больших животных - нас. Dawkinsian 10.05.11 в 05:58 0
	Жизнь разделялась на царство животных и растений, и различие казалось довольно очевидным. Dawkinsian 10.05.11 в 05:59 0
	Грибы считались растениями, поскольку наиболее известные из них укоренились на месте и не уходят от вас, пока вы пытаетесь их изучать. Dawkinsian 10.05.11 в 06:00 0
	До 19 века мы даже не знали о бактериях, и когда их впервые увидели через мощный микроскоп, люди не знали, куда их поместить в системе вещей. Dawkinsian 10.05.11 в 06:01 0
	Некоторые считали их миниатюрными растениями, другие - миниатюрными животными. Dawkinsian 10.05.11 в 06:02 0
	А третьи помещали светопоглощающих бактерий к растениям (как "сине-зеленые водоросли"), а остальных к животным. Dawkinsian 10.05.11 в 06:03 0
	Почти так же поступили с "протистами" - одноклеточными эукариотами, которые не являются бактериями и намного крупнее их. Dawkinsian 10.05.11 в 06:03 0
	Зеленых протистов назвали протофитами, а остальных протозоями. Dawkinsian 10.05.11 в 06:04 0
	Известным примером протозоя служит амеба, некогда считавшаяся близкой к великому предку всего живого - как мы ошибались, поскольку амеба едва отличима от людей, если смотреть "глазами" бактерий. Dawkinsian 10.05.11 в 06:06 0
	Все это было во времена, когда живых организмов классифицировали по их видимой анатомии, по которой бактерии гораздо менее разнообразны, чем животные или растения, и было простительно принижать их как примитивных животных и растений. Dawkinsian 10.05.11 в 06:07 0
	Совершенно другое дело обнаружилось, когда мы начали классифицировать существ, используя гораздо более богатую информацию, предоставляемую их молекулами, и когда мы изучили спектр химических "профессий", в совершенстве освоенных микробами. Dawkinsian 10.05.11 в 06:10 0
	Вот приблизительно как все выглядит сегодня. Dawkinsian 10.05.11 в 06:10 0
	Если к животным и растениям относиться как к паре царств, то, согласно тем же стандартам, существуют десятки микробных "царств", чья уникальность обеспечивает им право на тот же статус, как у животных и растений. Dawkinsian 10.05.11 в 06:12 0
	Диаграмма изображает верхушку айсберга. Dawkinsian 10.05.11 в 06:13 0

Следующая страница →